Hoppa till innehåll
Sök i kunskapsbanken
Sök bland bakterier, antibiotika och sjukdomar. Tryck Enter för att navigera.
Om Bakteriekort

Datakällor

Strama Gävleborg, Strama Uppsala, EUCAST-MIC, Swedres-Svarm och EARS-Net

Matrisen i Bakteriekort kombinerar flera olika datakällor. Den här sidan förklarar vad varje källa är, hur färgningen härleds, och vilka begränsningar du behöver känna till.

Så här fungerar datakällorna

Matrisen i Bakteriekort visar känslighet för antibiotika–bakterie-kombinationer. Bakom varje cell finns flera olika datakällor som kombineras eller väljs av användaren. Det här är inte alltid uppenbart vid första anblick — den här sidan förklarar hur det hänger ihop.

Två huvudtyper av data

Kategoriska rekommendationer (S/I/R/HD/UVI): Lokala expertgrupper — för närvarande Strama Gävleborg och Strama Uppsala — sammanställer kliniska rekommendationer i form av färgkodade matriser. Varje cell representerar ett ställningstagande: vanligen känslig, känslig vid hög dos, resistens kan förekomma, eller liknande. Det är en mänsklig syntes av lokala resistensdata, EUCAST-brytpunkter, klinisk erfarenhet och nationella riktlinjer.

Surveillance-data (kontinuerlig %R): Faktisk uppmätt resistens i isolat från svenska eller europeiska laboratorier. Tre källor används, i prioritetsordning: Swedres-SvarmEARS-NetEUCAST-MIC Den första källan med data för en given kombination vinner; om ingen har data dimmas cellen.

Hur de samspelar

I "Kategorisk" färgläge ser du den valda -källans rekommendation direkt. I "%R" färgläge ser du istället den faktiska andelen resistenta isolat enligt surveillance-prioritetsordningen. Du kan när som helst växla källa eller färgläge via inställningarna ovanför matrisen.

EUCAST-MIC används både som självständig kategorisk källa (då projiceras -fördelningar till S/I/R via brytpunkter) och som sista utväg i surveillance-fallbacken. Det är globala isolatdata snarare än svenska eller europeiska — användbart där svensk data saknas, men med större osäkerhet.

Varför detta är viktigt att förstå

Olika källor svarar på olika frågor. -rekommendationerna säger vad expertgruppen rekommenderar för empirisk terapi i en region. Surveillance-data säger vad som faktiskt observerats i isolat. EUCAST-MIC säger vad isolatfördelningen ser ut globalt. Klinisk användning kräver oftast en kombination — och förståelse för vilken fråga varje källa svarar på.

Datakälla

Strama Gävleborg

Region Gävleborgs lokala antibiotika- och bakteriekort. Default-källa i Bakteriekort. Sammanställs av Strama Gävleborg i samarbete med Klinisk Mikrobiologi vid Gävle sjukhus.

Strama Gävleborg är Region Gävleborgs regionala -grupp. De ger ut ett samlat antibiotika- och bakteriekort som täcker både sluten- och öppenvård, reviderat senast 2026. Kortet är default-källa i Bakteriekort. Färgkodningen i kortet bygger på lokala resistensdata från Klinisk Mikrobiologi vid Gävle sjukhus kombinerat med EUCAST-brytpunkter och nationella riktlinjer från Nationell.

Bakgrund

(Strategigruppen för rationell antibiotikaanvändning och minskad antibiotikaresistens) är en nationell samverkansstruktur med tre nivåer: en nationell arbetsgrupp (NAG regionala -grupper och ett bredare -nätverk. Sedan 1992 har den svenska antibiotikaanvändningen minskat med cirka 55 %.

Strama Gävleborg är Region Gävleborgs regionala gren. Gruppen är organisatoriskt kopplad till smittskyddsenheten med fysisk lokalisering på Gävle sjukhus. Klinisk Mikrobiologi vid Gävle sjukhus står som direkt källa för resistensdata i bakteriekortet.

Tidigare hade Strama Gävleborg en egen regional app som avvecklades 2023‑12‑31. Nationellt material samlas nu i appen Strama Nationell

Metodik

Antibiotika- och bakteriekortet är ett samlat dokument som täcker grampositiva och gramnegativa bakterier, både aeroba och anaeroba. Färgkodningen kombinerar:

  • Lokala resistensdata från Klinisk Mikrobiologi, Gävle sjukhus
  • EUCAST-brytpunkter (S/I/R-definitioner)
  • Nationella behandlingsrekommendationer från Nationell, Folkhälsomyndigheten och Läkemedelsverket
  • Klinisk erfarenhet och samråd med infektions- och mikrobiologspecialister

Kortet uppdateras ungefär vartannat år. Senaste revisionen är april 2026.

Varje cell tilldelas en kategori (vanligen S, ca 20–40 % resistenta, hög dos, UVI-indikation, eller ingen indikation) baserat på den samlade bedömningen. Detta är alltså en expertbedömning, inte en automatisk projektion av -fördelningar.

Tolkning i matrisen

När du har Strama Gävleborg vald som datakälla visas matrisen exakt som i deras PDF — samma färgkodning, samma fotnoter, samma ordningsföljd för bakterier och antibiotika.

I "Kategorisk" färgläge ser du Gävleborgs rekommendation direkt. I "%R" färgläge överskuggas bakgrundsfärgen av faktiska surveillance-data från Swedres-Svarm/EARS-Net/ -ECOFF (där sådan finns) — -färgen syns då bara om surveillance saknas eller är inaktiverad.

Cellerna är inte alltid identiska med Uppsalas matris för samma kombinationer. Det är medvetet och speglar regionala skillnader i klinisk praxis och lokal resistens.

Begränsningar

Kortet är en bedömning vid en tidpunkt. Resistensläget kan ha förändrats sedan senaste revisionen, särskilt för snabbt evolverande resistenser som ESBL och karbapenemaser. Vid osäkerhet, kontrollera mot färsk surveillance-data (Swedres-Svarm eller den aktuella PDF:en hos Region Gävleborg.

Det finns ingen publik beskrivning av hur ofta eller systematiskt den lokala resistensövervakningen samlas in och bearbetas inför revision. Vissa ovanliga bakterie–antibiotika-kombinationer kan därför ha svagare evidensgrund än de mer vardagliga.

Kortet täcker det som är kliniskt relevant i Region Gävleborg. Bakterier eller antibiotika som inte är aktuella där (t.ex. vissa importerade resistensmönster) kan vara underrepresenterade.

Källor och länkar

Datakälla

Strama Uppsala

Region Uppsalas susceptibilitetsöversikt, framtagen av Strama Uppsala i samarbete med Klinisk mikrobiologi vid Akademiska sjukhuset. Ett alternativ till Strama Gävleborg-vyn med delvis avvikande cellklassificering.

Strama Uppsala är Region Uppsalas regionala -grupp. De publicerar en susceptibilitetsöversikt — "Bakteriers känslighet för olika antibiotikasubstanser" — som täcker slutenvårdens vanliga patogener. Översikten avviker från Gävleborgs på flera celler där lokal resistens eller klinisk praxis skiljer sig. I Bakteriekort kan du växla mellan Strama Gävleborg och Strama Uppsala för att se hur de skiljer sig åt.

Bakgrund

Strama Region Uppsala drivs av Region Uppsala och är förankrad inom regionens smittskyddsenhet. Gruppen inkluderar infektionsläkare, infektionssjuksköterska och apotekare.

Underlaget för rekommendationerna kommer från Klinisk mikrobiologi vid Akademiska sjukhuset, vars resistensdata utgör basen för susceptibilitetsöversikten. För slutenvården publicerar gruppen även dokumentet "Empirisk antibiotikaterapi på Akademiska sjukhuset och Lasarettet i Enköping".

Strama Uppsala publicerar årsrapporter om antibiotikaförbrukning och resistensutveckling, med data både från primärvård (Primärvårdskvalitet) och slutenvård (Infektionsverktyget).

Metodik

Susceptibilitetsöversikten kombinerar:

  • Lokal resistensdata från Klinisk mikrobiologi, Akademiska sjukhuset
  • EUCAST-brytpunkter
  • Nationella rekommendationer från Folkhälsomyndigheten och Läkemedelsverket
  • Klinisk bedömning från gruppens infektions- och mikrobiologi-medlemmar

Översikten har samma kategoriska kodning som Gävleborg (S/I/R/HD/UVI/IND/UNC) men med åtta fotnoter där fotnoter 5–8 är Uppsala-specifika och adresserar t.ex. daptomycins inducerbara resistens, fluorokinolon-användning och cefalosporiners spektrum mot enterokocker

Den publicerade versionen är från oktober 2024. Uppdateringscykeln är inte offentligt definierad.

Tolkning i matrisen

När Strama Uppsala är vald datakälla visas matrisen enligt deras översikt. Vissa bakterier som inte finns med i Uppsalas dokument — bland annat Clostridioides difficile och Neisseria gonorrhoeae — döljs då i matrisen.

Skillnader mot Gävleborg är ofta små men kliniskt relevanta. Exempel: prevalensestimat för vissa kategorier ("ca 15–20 % resistenta" i Uppsala vs "ca 20–40 %" i Gävleborg), avvikande färgning för daptomycin mot enterokocker och olika positioner för fluorokinoloner.

I "%R"-läge fungerar fallbacken till surveillance-data på samma sätt som vid Gävleborg-vyn — -färgen ersätts av faktisk resistens-data där sådan finns.

Begränsningar

Susceptibilitetsöversikten är ett kortformat dokument som inte täcker alla bakterie–antibiotika-kombinationer. För dem som saknas kompletteras med Gävleborgs data där det är meningsfullt; i andra fall lämnas cellen tom.

Översikten reviderades senast oktober 2024 — kontrollera mot färsk Swedres-Svarm-data eller den aktuella PDF:en om resistensmönstret kan ha förändrats.

Liksom Gävleborgs kort representerar översikten en expertbedömning och inte en automatisk projektion av -fördelningar. Skillnader mellan Strama Uppsala och Strama Gävleborg speglar både olika lokal resistens och olika klinisk praxis.

Källor och länkar

Datakälla

EUCAST-MIC

Global -distribution från .eucast.org, projicerad till S/I/R via EUCAST:s kliniska brytpunkter eller ECOFF-fallback. Ger en datadriven syn på resistens som komplement till -rekommendationerna.

EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) drivs av ESCMID med stöd från ECDC och fastställer Europas kliniska brytpunkter och ECOFF-värden. Databasen mic.eucast.org innehåller över 30 000 -fördelningar insamlade världen över under 70 år. I Bakteriekort används EUCAST-data på två sätt: som en självständig kategorisk datakälla (där -fördelningar projiceras till S/I/R), och som sista utväg i surveillance-fallbacken när varken Swedres-Svarm eller EARS-Net har data.

Bakgrund

EUCAST grundades 1997 och fastställer, harmoniserar och reviderar europeiska brytpunkter för antibiotika. Organisationen har mandat från ESCMID och styrkommittén inkluderar ECDC, och EFSA. I Sverige implementeras EUCAST-standarder lokalt av Referensgruppen för antibiotikafrågor (RAF).

Reviderade brytpunktstabeller publiceras den 1 januari varje år. Aktuell version är v16.0 (januari 2026). USA använder parallellt CLSI:s system — EUCAST gäller i praktiken hela Europa och används av EARS-Net för deras surveillance.

Databasen eucastorg är fri och publik. Den visar histogram över -fördelningar per bakterieart och antibiotikum, med ECOFF överlagrad.

MIC, ECOFF och brytpunkter

(minimal inhibitorisk koncentration) är den lägsta antibiotikakoncentration som hämmar bakterietillväxt in vitro. För en given bakterieart bildar isolaten en fördelning: den stora toppen till vänster är vildtyps-populationen utan förvärvad resistens; isolat med resistensmekanismer återfinns vid högre -värden.

ECOFF (Epidemiological Cut-Off value) är det högsta -värde som definierar vildtyps-populationens övre gräns. Isolat med ECOFF är vildtyp (WT); isolat med > ECOFF är icke-vildtyp (NWT) och har någon form av förvärvad eller mutationsbaserad resistens. ECOFF säger alltså något om resistensmekanism, inte om kliniskt utfall.

Kliniska brytpunkter (S/I/R) tar däremot hänsyn till farmakokinetik, farmakodynamik och kliniska utfallsdata. Sedan 2019 gäller EUCASTs reviderade kategorier:

  • S (Susceptible, standard dose): Behandling förväntas lyckas med standarddos.
  • I (Susceptible, increased exposure): Behandling förväntas lyckas vid ökad exponering — högre dos, förlängd infusion eller hög koncentration vid infektionslokalen (t.ex. urinvägar). I innebär alltså fortfarande känslighet, inte resistens. Det är en omdefinition från det tidigare "Intermediate".
  • R (Resistant): Behandling förväntas misslyckas oavsett dosering.

I Bakteriekort projiceras -fördelningen mot brytpunkten för att bestämma cellens färgning: ≥95 % av isolaten under S-brytpunkten klassas som S, 75–95 % som I, <75 % som R.

När ECOFF används som fallback

För en del bakterie–antibiotika-kombinationer finns ingen klinisk brytpunkt — kanske för att antibiotikat inte är kliniskt relevant för arten, eller för att data är otillräcklig. I EUCAST-tabellerna markeras sådana med hakparenteser ("breakpoints in brackets").

I Bakteriekort används då ECOFF som surrogat-brytpunkt: vildtypsisolat klassas som S, icke-vildtyp som R, och cellen flaggas med koden UNC (uncertain). Det är en varning att S/R-klassningen här inte säger något om kliniskt utfall, bara om resistensmekanism.

Var försiktig med att tolka UNC-celler kliniskt. En cell som ECOFF-baserat är "S" kan ändå innebära att behandlingen misslyckas hos en patient — kliniska data saknas helt enkelt.

Tolkning i matrisen

EUCAST-MIC syns på två sätt i matrisen:

Som vald datakälla: Hela matrisen färgas enligt EUCAST-projektioner. S-, I-, R- och UNC-celler ger då en datadriven bild som kompletterar -rekommendationerna. Ovanliga kombinationer som inte tagit ställning till kan synas här.

Som surveillance-overlay i %R-läge: EUCAST-MIC används som sista utväg i fallbacken (Swedres-SvarmEARS-Net /ECOFF Andelen icke-vildtyp i fördelningen visas som %R i det smala fältet under cellen. Detta är inte svensk eller europeisk resistensdata utan globala isolat — användbart där svensk data saknas, men med större osäkerhet.

Färgskalan i %R-läget kan konfigureras (linjär, kliniskt viktad eller binnad) i matris-inställningarna.

Begränsningar

EUCAST-MIC innehåller globala isolat — bidrag från hela världen över 70 år. Det är inte en svensk eller europeisk resistens-snapshot. För frågan "hur ser resistens ut hos mina patienter just nu" är Swedres-Svarm en bättre källa.

ECOFF-baserade brytpunkter (UNC) bör inte tolkas som S/R i klinisk mening. De skiljer bara vildtyp från icke-vildtyp.

EUCAST reviderar tabellerna årligen den 1 januari. Brytpunkter kan ändras mellan versioner — projektionen i Bakteriekort baseras på den version som är inläst i datapipeline (för närvarande senast publicerad version vid datageneration).

Cirka 10–20 % av insamlade -fördelningar exkluderas vid ECOFF-bestämning enligt EUCAST SOP 10.1 (främst vid trunkering i den nedre änden), vilket innebär att ECOFF i sällsynta fall kan vara konservativt skattad.

Källor och länkar

Datakälla

Swedres-Svarm

Sveriges nationella årsrapport om antibiotikaanvändning och resistens. Primärkälla för surveillance-overlay i matrisen — täcker både invasiva isolat och urin-/luftvägsodlingar.

Swedres-Svarm är Sveriges nationella årsrapport om antibiotikaförbrukning och resistens, framtagen gemensamt av Folkhälsomyndigheten och Statens veterinärmedicinska anstalt (SVA). Den humanmedicinska delen bygger på Svebar — ett realtidssystem där 22 kliniska mikrobiologilaboratorier dagligen rapporterar alla odlingssvar. Swedres-Svarm är primärkällan i Bakteriekorts surveillance-fallback. Den är bredare än EARS-Net (inkluderar urin- och luftvägsisolat), är avgränsad till Sverige, och publiceras snabbare än ECDC:s europeiska sammanställningar.

Bakgrund

Swedres-Svarm har publicerats i nuvarande gemensamma format sedan 2012. Namnet kommer från de två delsystemen: Swedres (human medicin) och Svarm (veterinärmedicin). Rapporten täcker både människa, djur och livsmedel ur ett One Health-perspektiv.

Underlaget för den humanmedicinska delen är två parallella spår:

  • ResNet (sedan 1996): Alla kliniska laboratorier ombeds rapportera isolat från urinvägs-, sår- och luftvägsinfektioner. Detta är det bredare materialet som speglar primärvård och öppenvård.
  • Invasiva isolat (sedan 2001): Blod- och likvorisolat som matchar EARS-Nets definition och rapporteras vidare till ECDC.

Båda spåren flödar genom Svebar ett realtidssystem där 22 kliniska mikrobiologilaboratorier rapporterar dagligen. Svebar har förinställda larmalgoritmer som triggar e-postvarningar till lokala labbkontakter och Folkhälsomyndigheten vid kritiska resistensfenotyper.

Vad som täcks

Patogener som följs i humanövervakningen:

För varje patogen rapporteras både absoluta antal och andel resistenta isolat per antibiotikum. Data bryts ner per provmaterial där så är möjligt — invasivt, urin, luftvägar — vilket är centralt för matrisens "material-prioritering": invasivt vinner, men UVI-specifika preparat (pivmecillinam trimetoprim faller tillbaka till urinodlingar.

Datainsamlingen är i praktiken rikstäckande: nästan alla mikrobiologilaboratorier i landet ingår, och alla regioner är representerade.

Tolkning i matrisen

I "%R"-färgläge är Swedres-Svarm prioriterad surveillance-källa. För varje cell letar Bakteriekort efter data i prioritetsordning: Swedres-SvarmEARS-Net /ECOFF Den första källan som har data för den givna kombinationen (antibiotikum × bakterie × provmaterial) vinner.

I cell-tooltipen kan du se vilken källa som faktiskt använts. Material som visas är antingen invasivt eller — för UVI-relevanta preparat — urinodlingar.

Källprioriteten kan justeras eller en källa kan stängas av via matris-inställningarna. Vill du t.ex. jämföra svensk vs europeisk resistens-bild kan du sänka Swedres-Svarm i prioritet eller stänga av den helt.

Begränsningar

Nationellt aggregerat: Data publiceras på nationell nivå, inte regionalt. Resistensmönster kan variera regionalt — Skåne och Norrbotten har olika ESBL-prevalens — men det syns inte i Swedres-Svarm

Eftersläpande snapshot: Årsrapporten publiceras ungefär 6 månader efter dataårets slut (Swedres-Svarm 2024 publicerades i juni 2025). För akuta resistensutvecklingar är Svebars realtidssystem den operativa nivån.

Selektiv rapportering för ovanliga kombinationer: Resistensbestämning är i grunden frivillig och kan vara selektiv för sällsynta patogen–antibiotika-par. Det ger osäkerhet i undergrupper med litet n. Vid sällsynt resistens kan därför andelen vara över- eller underskattad.

Ingen mortalitets- eller utfallsdata: Swedres-Svarm rapporterar laboratoriedata, inte kliniska utfall. Att en bakterie är resistent in vitro betyder inte automatiskt att en patient kommer att försämras kliniskt vid behandling — andra faktorer spelar in.

Källor och länkar

Datakälla

EARS-Net

EU/EES-nätverkets surveillance av antibiotikaresistens i invasiva isolat (blod och likvor). Sekundärkälla i Bakteriekorts surveillance-fallback — användbar för EU-genomsnitt eller jämförelse mellan länder.

EARS-Net (European Antimicrobial Resistance Surveillance Network) drivs av ECDC och samlar resistensdata från 29 EU/EES-länder. Endast invasiva isolat (blod och likvor) från åtta definierade bakteriearter ingår. I Bakteriekort fungerar EARS-Net som sekundär surveillance-källa: när Swedres-Svarm saknar data för en kombination faller systemet tillbaka på EARS-Net. Du kan välja om svenska eller EU/EEA-aggregerade siffror ska visas.

Bakgrund

EARS-Net startade 1998 som EARSS (European Antimicrobial Resistance Surveillance System). År 2010 tog ECDC över och nätverket fick sitt nuvarande namn. Det är Europas största publikt finansierade AMR-övervakningssystem.

Sverige har deltagit i EARSS/EARS-Net sedan 2001 via Folkhälsomyndigheten. De svenska data som rapporteras till ECDC är samma data som ingår i Swedres-Svarm — det invasiva spåret.

Resultaten publiceras dels i ECDC:s Surveillance Atlas of Infectious Diseases (atlas.ecdc.europa.eu där man kan filtrera per land och år, dels i den årliga epidemiologiska rapporten ("Antimicrobial Resistance in the EU/EEA — Annual Epidemiological Report").

Vad som täcks

EARS-Net övervakar exakt åtta bakteriearter:

Endast invasiva isolat ingår — odlingar från blod eller likvor. Urin-, luftvägs- och sårodlingar exkluderas aktivt. Skälet är metodologiskt: invasiva isolat ger mest enhetliga data och minimerar skillnader i provtagningspraxis mellan länder.

Varje land rapporterar aggregerade resistensdata till ECDC en gång per år. Tolkningskriterierna ska helst följa EUCAST (cirka 80 % av länderna gör det 2024). Datakvalitet och representativitet bedöms årligen — 2024 hade 70 % av länderna hög representativitet.

Tolkning i matrisen

EARS-Net används i "%R"-läge som sekundär källa efter Swedres-Svarm Du kan välja vilken region som ska användas i matris-inställningarna:

  • Sverige (SE): Sveriges egna EARS-Net-rapportering. Detta är samma data som finns i Swedres-Svarms invasiva spår men ibland med någon månads eftersläpning.
  • EU/EEA: Aggregerat genomsnitt för hela EU/EES. Användbart för att se hur det europeiska resistensläget skiljer sig från det svenska — typiskt med högre prevalens i södra, centrala och östra Europa.

I cell-tooltipen visas vilken region som använts. Källprio och region kan justeras eller stängas av via matris-inställningarna.

Begränsningar

Endast invasivt: EARS-Net täcker bara blod- och likvorisolat. Resistens i urinvägsinfektioner, luftvägsinfektioner eller sårinfektioner finns inte i EARS-Net För en svensk kliniker som behandlar en okomplicerad UVI är Swedres-Svarms ResNet-spår betydligt mer användbart.

Selektionsbias: Invasiva isolat kommer från patienter med svår infektion, ofta på sjukhus och ofta med tidigare antibiotikaexponering. Resistensandelen är därför systematiskt högre än bland öppenvårdsodlingar — ett invasivt E. coli har oftare ESBL än ett urinodlat E. coli i primärvård.

Eftersläpning: ECDC:s årsrapport publiceras typiskt 6–12 månader efter Swedres-Svarm eftersom data ska samlas från alla länder. För svenska data ger Swedres-Svarm aktuellare bild.

Begränsat artsortiment: Endast åtta arter. Anaeroba bakterier, mykobakterier, jästsvampar och flera kliniskt relevanta gram-negativa stavar (t.ex. Stenotrophomonas) ingår inte.

Datakvalitet varierar mellan länder: Tolkningskriterier (EUCAST vs CLSI), sampling-praxis och representativitet skiljer sig — något att hålla i åtanke vid jämförelser mellan länder.

Källor och länkar

bakteriekort.se · Baserat på Strama och Folkhälsomyndigheten